空のフォルダが削除できないのはIMEの誤変換レポートのせいだった

空のフォルダを削除しようとして「別のプログラムがこのフォルダーまたはファイルを開いているので、操作を完了できません。」と出る場合、タスクトレイのアイコン（どのアイコンか画像撮り忘れました）をクリックして、誤変換レポートのダイアログが出る場合は、閉じてみましょう。

ダイアログを閉じると、空のフォルダが削除できるようになります。

参考

Windowsで「別のプログラムがこのフォルダーまたはファイルを開いているので、操作を完了できません。」と表示されて削除やリネームできない場合の対処方法
ちゃっぴさんのツイート: “IMECFMUI.exe が原因で folder が削除できなかった。なんなんだ誤変換通知 utility”